Để tìm hiệu của số lẻ nhỏ nhất có sáu chữ số và số chẵn lớn nhất có năm chữ số khác nhau, ta thực hiện như sau:

1. **Số lẻ nhỏ nhất có sáu chữ số**:
- Số lẻ nhỏ nhất có sáu chữ số là **100001**.

2. **Số chẵn lớn nhất có năm chữ số khác nhau**:
- Số chẵn lớn nhất có năm chữ số khác nhau là **98760** (các chữ số 9, 8, 7, 6, 0 đều khác nhau và số này là chẵn).

3. **Tính hiệu**:
\[
100001 - 98760 = 12041
\]

Vậy, hiệu của số lẻ nhỏ nhất có sáu chữ số và số chẵn lớn nhất có năm chữ số khác nhau là **12041**.