Bởi vì ở miệng và dạ dày, thức ăn được biến đổi về mặt cơ học là chủ yếu, chỉ một phần protid và carbohydrat được biến đổi hoá học. Chỉ khi đến ruột non với đầy đủ các enzyme, thức ăn mới được biến đổi về mặt hoá học thành các chất dinh dưỡng đơn giản cơ thể có thể hấp thụ được.

Trong quá trình tiêu hóa, thức ăn được xử lý và phân hủy thành các chất dinh dưỡng như protein, carbohydrate và lipid để cung cấp năng lượng cho cơ thể. Quá trình này chủ yếu dựa vào các phản ứng hóa học xảy ra trong ruột non. Các enzym và acid trong dạ dày và ruột non giúp phân hủy thức ăn thành các phân tử nhỏ hơn có thể hấp thụ qua thành ruột non vào máu. Do đó, việc nói về hóa học trong quá trình tiêu hóa là cực kỳ quan trọng để hiểu rõ cách cơ thể chuyển hóa thức ăn thành năng lượng và chất dinh dưỡng cần thiết.