- Đối với con người:

+ Gây ra ngộ độc thực phẩm khi sử dụng thực phẩm chứa chất hóa học quá mức quy định.

+ Gây ra các bệnh lí như bệnh ung thư, các bệnh về hệ thống thần kinh (rối loạn thần kinh, bệnh Parkinson, bệnh bạch cầu ở trẻ em, hen suyễn) và các vấn đề sinh sản ở những người tiếp xúc với thuốc trừ sâu,...

- Đối với động, thực vật tự nhiên:

+ Diệt cả những côn trùng hữu ích cho con người như ong và bươm bướm - những động vật có ích trong việc tự thụ phấn tự nhiên.

+ Việc lạm dụng quá nhiều thuốc trừ sâu hoặc sử dụng thuốc trừ sâu không đúng cách cũng dẫn đến làm hư hại cây trồng.

+ Có thể làm biến đổi thế cân bằng tự nhiên của hệ sinh thái.

- Đối với môi trường:

+ Gây ô nhiễm đất, làm đất bị thoái hóa trầm trọng, bị chua, độ xốp giảm và dẫn đến khả năng không thể tái tạo lại dinh dưỡng cho đất.

+ Gây ô nhiễm nước sông, nước ngầm.

+ Gây ô nhiễm không khí.