Vệ sinh an toàn thực phẩm trong khâu chế biến là từ để miêu tả việc xử lý, chế biến, bảo quản và lưu trữ thực phẩm với các phương pháp phòng ngừa, phòng chống bệnh tật bởi thực phẩm gây ra. Việc vệ sinh này cũng bao gồm một vài thói quen, thao tác ở khâu chế biến để tránh những nguy cơ sức khỏe tiềm năng nghiêm trọng.

Việc vệ sinh này chính là việc giữ cho thực phẩm không bị nhiễm khuẩn, nhiễm độc, ngộ độc thực phẩm. Thực phẩm được biết như việc vệ sinh các thực phẩm được xử lý và bảo quản sạch sẽ ở quá trình sản xuất, chăm sóc và đóng gói, chế biến.