Việc tạo sơ đồ tư duy theo cách thủ công có một số nhược điểm như sau:

Mất thời gian: Việc vẽ sơ đồ tư duy bằng tay có thể mất nhiều thời gian, đặc biệt là khi bạn muốn tạo ra một sơ đồ lớn hoặc phức tạp.
Khó chỉnh sửa: Khi bạn muốn thay đổi hoặc thêm thông tin vào sơ đồ, việc làm này có thể trở nên khó khăn. Bạn có thể phải vẽ lại toàn bộ sơ đồ.
Không chuyên nghiệp: Sơ đồ tư duy vẽ tay có thể không mang lại vẻ ngoài chuyên nghiệp như khi bạn sử dụng phần mềm.
Khó chia sẻ và lưu trữ: Sơ đồ tư duy vẽ tay khó được chia sẻ trực tuyến hoặc lưu trữ điện tử, điều này có thể gây khó khăn trong việc cộng tác và lưu trữ.
Giới hạn về không gian: Bạn có thể bị giới hạn bởi không gian trên giấy, điều này có thể hạn chế sự phát triển của sơ đồ tư duy của bạn.
Tuy nhiên, việc tạo sơ đồ tư duy theo cách thủ công cũng có những ưu điểm riêng, chẳng hạn như tạo ra sự kết nối cá nhân hơn với thông tin và giúp cải thiện kỹ năng tư duy phản biện.