Có nhiều giả thuyết về nguồn gốc của virus, nhưng một giả thuyết phổ biến là virus được hình thành từ chính các tế bào chủ. Theo giả thuyết này, một số đoạn gen tách ra khỏi DNA hoặc RNA của tế bào chủ và sau đó tự tổng hợp cho mình lớp vỏ protein để hình thành nên hạt virus.

Có một số bằng chứng ủng hộ cho giả thuyết này. Ví dụ, virus có kích thước rất nhỏ, chỉ bằng một phần nhỏ của một tế bào. Điều này cho thấy chúng không thể tự sống mà cần phải ký sinh trên các tế bào khác. Ngoài ra, virus không có khả năng tự tổng hợp các protein của riêng mình. Thay vào đó, chúng phải sử dụng các protein của tế bào chủ để tạo ra các hạt virus mới.

Một bằng chứng khác ủng hộ cho giả thuyết này là virus có thể lây nhiễm cho nhiều loại tế bào khác nhau. Điều này cho thấy virus không phải là một loại tế bào riêng biệt mà là một đoạn gen có thể lây nhiễm cho bất kỳ tế bào nào có bộ gen phù hợp.

Mặc dù có nhiều bằng chứng ủng hộ cho giả thuyết này, nhưng vẫn chưa có bằng chứng chắc chắn chứng minh rằng virus thực sự được hình thành từ chính các tế bào chủ. Tuy nhiên, giả thuyết này vẫn là giả thuyết phổ biến nhất về nguồn gốc của virus.

Ngoài ra, còn một số giả thuyết khác về nguồn gốc của virus, chẳng hạn như:

Virus có thể là những mảnh vỡ của tế bào đã bị nhiễm bệnh và không thể tự sửa chữa được.
Virus có thể là những sinh vật sống đơn giản nhất trên Trái đất.
Virus có thể là một loại vật chất ngoài Trái đất.
Tuy nhiên, các giả thuyết này vẫn chưa được chứng minh và giả thuyết về virus hình thành từ chính các tế bào chủ vẫn là giả thuyết phổ biến nhất hiện nay.